Tres niños se unen a las sacerdotisas de Mothra en un viaje para encontrar el tesoro perdido de Nilai Kinai, una antigua civilización desaparecida bajo el mar, con la esperanza de detener la destrucción del medio ambiente. De la contaminación ha surgido el malvado monstruo Dagahra, una criatura aparentemente demasiado poderosa incluso para Mothra. Como resultado, el destino del medio ambiente está en manos del tesoro perdido