El archienemigo de Sonic, el Dr. Robotnik, ha sido desterrado de la Tierra de las Tinieblas por un malvado Robotnik de Metal. El taimado doctor le dice a Sonic que el generador robot ha sido saboteado y que hará volar el Planeta Libertad por los aires. Pero no es hasta que Sara, la bella hija del presidente, se muestra encantadora cuando Sonic entra en acción.